当前位置:首页 >> 基础医学 >>

组学技术的快速发展


蛋白质组学技术在课题设计及基金申请的解决方案学习班
2016 年 1 月 16-17 日(周六、周日) 上海
(同月将举办科研基金申请与 SCI 论文撰写研讨班、系统评价与 meta 分析及临床科研设计、研究计划书 制定和数据管理学习班详细内容咨询招生老师)

目前,高通量的基因组、转录组学技术非常成熟,能大规模的对样品 DNA 和 RNA 进行分析, 筛选到成千上万的差异表达基因。 但是有一个核心的问题, 即 DNA/RNA 的水平与蛋白质的水平没 有正相关性 (<30%) , 导致在基因层面上筛选到差异表达基因往往不能映射到蛋白质水平; 此外, 蛋白质区别于 DNA/RNA 的另一个显著特性—翻译后修饰 (磷酸化、 乙酰化、 甲基化、 泛素化、 SUMO 化等) , 蛋白质翻译后修饰往往会影响/改变蛋白质的活性和功能。 蛋白质的翻译后修饰显然无法 在 DNA 和 mRNA 水平上进行检测。 现在是后基因组时代。绝大多数的生物学/医学的学术文章,都要求做到蛋白质水平。鉴于 DNA/RNA 与蛋白质的诸多差异,直接从蛋白质水平入手,对样品进行分析是大势所趋。LC-MS 为 基础的蛋白质组学技术的快速发展, 为蛋白质的高通量分析和后续特定蛋白质的深入功能解析提 供了强有力的技术保障,其突出优势体现在: (1)高通量地对未知蛋白质样品进行分析,能一次 从样品中鉴定到成千上万种蛋白质; (2)真正做到有的放矢。通过 LC-MS 分析,能一目了然地知 晓样品中的蛋白质具体信息。此外,各种定量技术的引入(SILAC、iTRAQ、TMT、label-free、 MRM 等) ,不但能知道样品中有什么蛋白质,同时又能对多组样品中的每一个蛋白质的表达水平 进行相对/绝对的定量,有利于快速锁定目标分子,从而进行深入的生物学功能分析; (3)能直 接对各种翻译后修饰进行鉴定与定量分析。 通过 LC-MS 为基础的蛋白质组学技术, 您可以进行差异蛋白质组学分析 (筛选样本中差异表达的 蛋白质) 、相互作用分析(蛋白质与蛋白质、DNA、RNA、小分子等)和蛋白质翻译后修饰分析(甲 基化、磷酸化、乙酰化等)等,能鉴定/定量成百上千个蛋白质/位点,拥有了专属于您的、样品 特异性的蛋白质组数据库。问题: (1)在这么多的蛋白质中,如果锁定感兴趣的目标分子?(2) 如何运用传统的生物学技术和方法对筛选到的目标分子进行细致的生物学功能分析,为文章添 色,提高文章的档次? 本课程将从 LC-MS 为基础的蛋白质组学技术原理出发, 结合发表的学术文章, 对目前的主流 蛋白质组学技术进行详细讲解, 旨在帮助学员深入理解蛋白质组学技术的原理、 优势以及如何将 蛋白质组学技术系统地整合到自己的课题设计和标书申请项目中。 课程解决内容: 什么是蛋白质组和蛋白质组学? 蛋白质组学的研究内容是什么? LC-MS 进行蛋白质鉴定的具体原理 1、LC 的作用 2、MS 数据采集 数据库搜索(database search)如何完成蛋白质的鉴定? 1、蛋白质组数据库资源及下载 2、MS 数据搜库及蛋白质鉴定 2D-gel 的技术原理 结合文献,讲解 2D-gel 结合 MALDI-TOF MS 进行差异蛋白质组学分析方案 1、样品类型及实验设计 2、2D-gel 分离及差异点筛选 3、差异点 MALDI-TOF MS 鉴定 4、差异蛋白质验证及功能分析 结合文献,讲解免疫共沉淀(Co-IP)结合 LC-MS 进行蛋白质相互作用分析方案 1、免疫共沉淀实验设计 2、免疫沉淀蛋白质复合物纯化 3、差异条带切割、酶解及 LC-MS 鉴定

4、蛋白质功能注释查询及目标分子筛选 5、目标分子的生物学功能实验解析相互作用的分子机制 SILAC 定量蛋白质组学技术原理 SILAC 实验设计 结合文献,讲解 SILAC 结合 LC-MS 进行细胞差异蛋白质组学分析方案 1、实验设计及流程 2、蛋白质 LC-MS 鉴定及定量分析 3、根据定量结果,筛选差异表达的蛋白质(几百个) 4、生物信息学(GO 分类、pathway 聚类等)分析差异表达的蛋白质 5、生物学实验验证蛋白质组学数据 结合文献,讲解 SILAC 结合免疫沉淀(Co-IP)和 LC-MS 进行蛋白质相互作用分析方案 1、SILAC+Co-IP 实验设计 2、Co-IP 纯化蛋白质复合物及 SDS-PAGE 分离 3、蛋白质复合物 LC-MS 鉴定与定量 4、定量结果分析,筛选潜在的特异性相互作用蛋白(几十个) 5、生物信息学(GO 分类、pathway 聚类等)分析特异性相互作用蛋白质 6、Co-IP 结合 Western blot 验证特异性相互作用 7、特定相互作用蛋白的生物学功能解析 结合文献,讲解运用 SILAC 技术对模式生物进行差异定量蛋白质组学分析方案 模式生物 SILAC 技术原理 模式生物 SILAC 实验设计 蛋白质 LC-MS 鉴定与定量 根据定量结果,筛选差异表达的蛋白质 差异表达蛋白质的功能分析 结合文献,讲解运用 SILAC 技术(super-SILAC)对人体病理组织进行差异比较定量蛋白质 组学分析方案 Super-SILAC 的技术原理 Super-SILAC 实验设计 Super-SILAC 结合 LC-MS 对蛋白质样品进行鉴定与定量分析 iTRAQ/TMT 技术原理 iTRAQ/TMT 实验设计 结合文献,讲解运用 iTRAQ/TMT 技术进行差异蛋白质组学分析方案 1、iTRAQ/TMT 实验设计及流程 2、蛋白质 LC-MS 鉴定与定量 3、定量数据分析,筛选差异表达蛋白 4、差异表达蛋白质生物学方法(western blot、ELISA 等)验证 5、差异表达蛋白质功能解析 Label-free 定量蛋白质组学技术原理 结合文献,讲解运用 label-free 技术进行差异蛋白质组分析 生物信息学开放资源及软件简介 1、蛋白质功能查询:Uniprot、genecards 等 2、蛋白质相互作用查询:HPRD、Biogrid 等 3、蛋白质功能分类:GO、DAVID、Panther 等 4、信号通路分析:KEGG 等 5、蛋白质相互作用网络:STRING、Cytoscape 等 本班特色 1、本班授课采用通俗易学的模式授课,让你从零基础开始,一步一步理解 LC-MS 为基础的蛋白 质组学技术原理,在此基础上,并更进一步理解目前主流的定量蛋白质组学技术( SILAC 、 iTRAQ/TMT、label-free 等)的原理及应用。

2、以发表的学术文章作为实例, 系统讲解每一种蛋白质组学技术的应用方案及策略, 举一反三, 让你完全理解每种技术的特色优势,能在将来将其整合到自己的研究方案和课题中。 3、以大量的实例图片出发,系统讲解目前主流的、以 LC-MS 为基础的蛋白质组学技术原理。各 种技术分别讲解,系统分析每种技术的特色优势及应用。 4、结合文献实例,深入浅出地分析每种蛋白质组学技术的设计思路、实验方法、数据分析、目 标筛选、功能实验等具体细节,加深和强化对蛋白质组学技术的理解。 5、从生物学/医学研究的实际出发, 在产出的蛋白质组学数据的基础上, 如何筛选和锁定目标分 子, 如何设计实验对目标分子进行深入的功能分析 (包括分子水平、 细胞水平和动物模型等层面) , 以提升文章的档次。 主讲老师 唐博士。2010 年毕业于复旦大学生物医学研究院,获蛋白质组学与系统生物学专业博士学位。 研究方向是将 LC-MS 为基础的蛋白质组学技术与传统生物学方法有机整合,系统进行蛋白质 蛋白质相互作用、蛋白质翻译后修饰、肿瘤分子标志物筛选等工作。整体的研究思路是借助于 LC-MS 的为基础的蛋白质组学技术,高通量的对样本的蛋白质组分进行系统分析,发现和筛选 新的目标蛋白质分子。后续利用传统的生物学实验手段,系统解析目标分子的分子机理。先后在 Journal of Proteome Research 等专业性学术期刊上发表了多篇学术论文。 主办单位:上海玮瑜生物科技有限公司 上海服淡信息科技有限公司 时间地点: 2016 年 1 月 15 日报到,16 日-17 日授课。上海良友饭店(上海市静安区南苏州路 1455 号) 住宿统一安排在上海良友饭店。标准间单住 260 元/人、合住 130 元/人(含早餐),费用自理。 合住的学员最后出现单人无法安排的情况,需要自补房间差价。 注册费用: 2100 元/人,同一单位三人以上 1900 元/人。授课期间发放纸质邀请函(盖章)和发票。 按交费先后顺序确定座位号。培训期间提供午餐,晚餐自理。 付款方式: A:银行转账 账户名称:上海服淡信息科技有限公司 账户号:31578103002581719 开户行:上海银行桃浦支行 B:支付宝转账 收款人:wybiot@163.com 支付宝户名:上海玮瑜生物科技有限公司 联系方式: 联系人:谢老师 手机号:13611825136 ;E-mail:ganj17@163.com 如 您 或 您 的 学 生 计 划 参 加 请 填 写 报 名 表 并 于 报 到 前 发 送 至 联 系 人 E-mail : ganj17@163.com。为确保您已报名成功,请之后来电或者发短信予以确认。如有疑问,欢 迎垂询! 回 执 表 地点:上海良友饭店 时间:2016 年 1 月 16 日-17 日 请用“■”代替“□” 单位名称 邮编 单位地址 姓名 性别 常用邮箱 手机 导师邮箱

发票抬头 注册费 是否代定 住宿

(务必填写正确) 大写: 万 千 百 十 元整 小写: □双人间:培训人员优惠价 130 元/天/人。 是□ □单人间:培训人员优惠价 260 元/天/间。 否□ 入住时间 退房日期

(不含住宿费)


相关文章:
生物信息学与组学
生物信息学与组学 - 生物信息学与组学 Zujia.W 摘要: 随着新一代测序技术、蛋白质谱技术等高通量技术的快速发展,生 命科学领域进入了“后基因组时代” ,进入...
营养组学研究进展
营养组学研究进展 - 1.论述一下营养组学在食品研究领域的应用与发展前景? 答: (1)营养组学在食品研究领域的应用: 营养基因组学是研究营养素和植物化学物质对...
宏基因组学概述
宏基因组学概述 - 宏基因组学概述 王莹,马伊鸣 (北京交通大学 土木建筑工程学院 环境 1402 班) 摘要:随着分子生物学技术的快速发展及其在微生物生态学和环境微...
转录组测序技术的应用及发展综述
转录组测序技术的应用及发展综述_生物学_自然科学_专业资料。转录组测序技术的...转录组测序(RNA-Seq)是指利用第二代高通量测序技术进行 cDNA 测序, 全面快速...
代谢组学综述
代谢组学综述 - 组学概论 代谢组学综述 摘要: 代谢组学是 20 世纪 90 年代中期发展起来的对某一生物或细胞所有低相对 分子质量代谢产物进行定性和定量分析的一...
浅谈蛋白质组学及其发展趋势
二:蛋白质组学研究的主要技术 蛋白质组学研究主要涉及有两方面的内容: 一是...此外,蛋白 质芯片的发展也十分迅速,并已经在临床诊断中得到应用。 三:发展方向...
生物信息学的发展历程
生物信息学的发展历程生命科学领域原始研究数据,尤其是序列数据的快速积累,为发现...自从 20 世纪 80 年代启动人类基因组测序计划以来,各种高通量技术引起生物数据的...
系统生物学-整合各种组学的信息和方法
人类基因组计划和随后发展的各种组学技术把生物学 带入了系统科学的时代。 系统生物学是在细胞、组织、器官和生物体整体水平研究结构和功能各异的各种分子 及其相互...
代谢组学在药物发现和精准医学中的应用
随着代谢组学检测技术的发展, 代谢组学在药物发现中的作用凸显。不仅如此,由于...代谢组学和肿瘤的精准医学治疗 个性化治疗或精准医学在肿瘤治疗领域中发展。...
代谢组学在医药领域的应用与进展
了解代谢组学发展趋势 二、正文 基因组功能解析是后基因组时代生命科学研究的...快速准确寻找相应的生物标记物和应用代谢组新技术进行代谢表型和功能基因组研究提供...
更多相关标签: